48合成仪设计用于合成结构上类似DNA或RNA的寡核苷酸的自动化仪器。一般应用于固相合成法， 每次将一个核苷酸加到所接长的寡核苷酸链上，加入每一个核苷酸都利用相同的化学反应 与相应的嘌呤或嘧啶碱基衍生物作用。
48合成仪使用步骤：
1、仔细检查合成仪上所有试剂瓶中的试剂量，必要时换掉试剂瓶，特别注意Z腈的量，因为该溶剂用量较大。
2、将标记好的清洁的收集瓶装在合成仪上。
3、将要合成的DNA序列输入合成仪。
4、检查选择的合成步骤是否正确。
5、选择结束方法: TritylOffAuto是仪器的原始状态， 若打算以5，DMT基团连接纯化寡核苷酸，将其转变为TritylOnAuto结束状态。
6、选择结束方法，一般为系统的原始状态。
7、在每个柱监视器的Username下，输入你所希望的保存名字。
8、以代码代替相应的DNA序列标记每一个收集 瓶。
9、打印出每一个柱设置的详细资料。
10、检查打印出来的资料是否正确。
11、运行StartColumn步骤检查每一个柱的位置， 确保合成仪上合成柱处于正确的位置。
12、检查连接在合成仪上的溶剂残留(废液瓶、是否充满。
13、如果分部收集器用来收集每个DMT脱保护步骤的流出物，确保试管充分清洁干净，并打开分部收集器，确保DMT废液管路通向分部收集器。
14、启动循环，运行开始程序清洗试剂管路，除去原来的试剂。
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